Si el objeto objetivo es soluble en agua y tiene polaridad débil o media, puedes elegir sílice C8 o C4.

Si el objeto objetivo es soluble en agua y tiene polaridad media o fuerte, puedes elegir sílice C18.

C4 y C18 revelan la cantidad de moléculas de carbono en los materiales de fase fija en agrupaciones de siloxano. Cuantos más átomos de carbono, mayor es la no polaridad de la fase estacionaria.

La longitud de la cadena alquílica obviamente importa. Las cadenas más largas tienen mucha más retención que las más cortas.

Del mismo modo, las cadenas más largas permiten el uso de muestras mucho más grandes. Por ejemplo, puedes duplicar el tamaño de la muestra en la fase C18 en comparación con la fase C4 en condiciones similares，se prefiere C18 para muestras menos polares.